Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE1BQ01064 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE1BQ01064 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE1BQ01064 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms