Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2C1P98194 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2C1P98194 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2C1P98194 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2C1P98194 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms