Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNB1P98172 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms