Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOAP61586 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOAP61586 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOAP61586 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOAP61586 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOAP61586 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOAP61586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOAP61586 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOAP61586 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOAP61586 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOAP61586 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOAP61586 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOAP61586 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOAP61586 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOAP61586 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOAP61586 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOAP61586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOAP61586 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOAP61586 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOAP61586 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOAP61586 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOAP61586 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOAP61586 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOAP61586 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOAP61586 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOAP61586 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOAP61586 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOAP61586 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOAP61586 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOAP61586 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOAP61586 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOAP61586 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOAP61586 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOAP61586 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOAP61586 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOAP61586 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHOAP61586 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOAP61586 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHOAP61586 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOAP61586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOAP61586 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOAP61586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOAP61586 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOAP61586 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms