Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RWDD2BP57060 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RWDD2BP57060 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RWDD2BP57060 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1282 ms