Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS1P54277 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS1P54277 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PMS1P54277 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PMS1P54277 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS1P54277 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS1P54277 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS1P54277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMS1P54277 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS1P54277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS1P54277 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS1P54277 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS1P54277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMS1P54277 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMS1P54277 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS1P54277 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS1P54277 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS1P54277 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS1P54277 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMS1P54277 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PMS1P54277 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PMS1P54277 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMS1P54277 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS1P54277 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS1P54277 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS1P54277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMS1P54277 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMS1P54277 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS1P54277 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS1P54277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS1P54277 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS1P54277 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMS1P54277 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS1P54277 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS1P54277 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS1P54277 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS1P54277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMS1P54277 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMS1P54277 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PMS1P54277 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS1P54277 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS1P54277 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS1P54277 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMS1P54277 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMS1P54277 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMS1P54277 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMS1P54277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS1P54277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS1P54277 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMS1P54277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMS1P54277 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS1P54277 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PMS1P54277 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms