Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24CP53992 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24CP53992 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24CP53992 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24CP53992 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms