Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACLYP53396 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACLYP53396 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACLYP53396 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACLYP53396 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ACLYP53396 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACLYP53396 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ACLYP53396 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACLYP53396 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACLYP53396 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACLYP53396 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ACLYP53396 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACLYP53396 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACLYP53396 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACLYP53396 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACLYP53396 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACLYP53396 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACLYP53396 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACLYP53396 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ACLYP53396 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACLYP53396 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACLYP53396 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACLYP53396 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACLYP53396 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACLYP53396 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACLYP53396 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACLYP53396 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACLYP53396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACLYP53396 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACLYP53396 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACLYP53396 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACLYP53396 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACLYP53396 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACLYP53396 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACLYP53396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACLYP53396 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACLYP53396 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACLYP53396 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACLYP53396 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACLYP53396 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACLYP53396 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACLYP53396 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACLYP53396 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ACLYP53396 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACLYP53396 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACLYP53396 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACLYP53396 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACLYP53396 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACLYP53396 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACLYP53396 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACLYP53396 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACLYP53396 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ACLYP53396 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACLYP53396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACLYP53396 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACLYP53396 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACLYP53396 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACLYP53396 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACLYP53396 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ACLYP53396 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACLYP53396 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACLYP53396 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACLYP53396 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACLYP53396 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACLYP53396 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACLYP53396 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 455.9 ms