Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2A2P52657 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2A2P52657 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF2A2P52657 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF2A2P52657 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.1 ms