Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NESP48681 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NESP48681 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NESP48681 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NESP48681 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
NESP48681 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
NESP48681 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NESP48681 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
NESP48681 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
NESP48681 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NESP48681 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NESP48681 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NESP48681 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
NESP48681 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
NESP48681 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NESP48681 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
NESP48681 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
NESP48681 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NESP48681 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
NESP48681 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
NESP48681 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
NESP48681 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NESP48681 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NESP48681 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
NESP48681 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
NESP48681 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NESP48681 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NESP48681 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
NESP48681 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NESP48681 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NESP48681 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NESP48681 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NESP48681 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NESP48681 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NESP48681 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NESP48681 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NESP48681 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
NESP48681 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.44
NESP48681 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
NESP48681 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NESP48681 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NESP48681 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NESP48681 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NESP48681 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NESP48681 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NESP48681 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
NESP48681 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NESP48681 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NESP48681 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
NESP48681 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NESP48681 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
NESP48681 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NESP48681 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NESP48681 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
NESP48681 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NESP48681 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NESP48681 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NESP48681 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
NESP48681 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NESP48681 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
NESP48681 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NESP48681 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
NESP48681 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
NESP48681 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
NESP48681 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
NESP48681 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
NESP48681 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
NESP48681 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
NESP48681 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NESP48681 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NESP48681 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NESP48681 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
NESP48681 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NESP48681 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NESP48681 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
NESP48681 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NESP48681 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NESP48681 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms