Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHKAP35790 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHKAP35790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHKAP35790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHKAP35790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHKAP35790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKAP35790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKAP35790 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKAP35790 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHKAP35790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKAP35790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKAP35790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHKAP35790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHKAP35790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHKAP35790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHKAP35790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHKAP35790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKAP35790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKAP35790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKAP35790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKAP35790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKAP35790 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKAP35790 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHKAP35790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHKAP35790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHKAP35790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHKAP35790 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHKAP35790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms