Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNNB1P35222 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTNNB1P35222 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTNNB1P35222 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTNNB1P35222 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms