Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDC2P34741 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDC2P34741 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDC2P34741 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDC2P34741 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDC2P34741 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDC2P34741 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDC2P34741 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDC2P34741 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDC2P34741 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDC2P34741 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDC2P34741 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDC2P34741 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDC2P34741 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDC2P34741 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDC2P34741 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDC2P34741 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDC2P34741 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDC2P34741 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDC2P34741 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDC2P34741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDC2P34741 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDC2P34741 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDC2P34741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDC2P34741 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDC2P34741 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDC2P34741 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDC2P34741 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDC2P34741 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms