Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCD1P33897 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ABCD1P33897 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCD1P33897 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms