Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASQ1P31415 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASQ1P31415 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms