Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2E2P29084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2E2P29084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2P29084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms