Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAX3P23760 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PAX3P23760 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PAX3P23760 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAX3P23760 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAX3P23760 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX3P23760 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX3P23760 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAX3P23760 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAX3P23760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX3P23760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX3P23760 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX3P23760 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX3P23760 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX3P23760 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX3P23760 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX3P23760 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX3P23760 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAX3P23760 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX3P23760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX3P23760 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX3P23760 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX3P23760 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX3P23760 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX3P23760 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX3P23760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PAX3P23760 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX3P23760 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAX3P23760 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAX3P23760 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAX3P23760 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PAX3P23760 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAX3P23760 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAX3P23760 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAX3P23760 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX3P23760 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX3P23760 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX3P23760 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAX3P23760 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX3P23760 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX3P23760 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX3P23760 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAX3P23760 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX3P23760 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PAX3P23760 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PAX3P23760 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX3P23760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX3P23760 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX3P23760 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX3P23760 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX3P23760 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAX3P23760 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX3P23760 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX3P23760 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAX3P23760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX3P23760 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX3P23760 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX3P23760 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms