Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CA4P22748 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CA4P22748 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA4P22748 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA4P22748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CA4P22748 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CA4P22748 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CA4P22748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CA4P22748 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CA4P22748 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CA4P22748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CA4P22748 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CA4P22748 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA4P22748 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CA4P22748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA4P22748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CA4P22748 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CA4P22748 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CA4P22748 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CA4P22748 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CA4P22748 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CA4P22748 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA4P22748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CA4P22748 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CA4P22748 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CA4P22748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CA4P22748 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA4P22748 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA4P22748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CA4P22748 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA4P22748 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CA4P22748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA4P22748 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA4P22748 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CA4P22748 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CA4P22748 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA4P22748 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CA4P22748 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CA4P22748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CA4P22748 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CA4P22748 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms