Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1L1P21108 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1L1P21108 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms