Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARF4P18085 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARF4P18085 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARF4P18085 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARF4P18085 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARF4P18085 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARF4P18085 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARF4P18085 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARF4P18085 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARF4P18085 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARF4P18085 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARF4P18085 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARF4P18085 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARF4P18085 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARF4P18085 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARF4P18085 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARF4P18085 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARF4P18085 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARF4P18085 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARF4P18085 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARF4P18085 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARF4P18085 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARF4P18085 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARF4P18085 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARF4P18085 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARF4P18085 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARF4P18085 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARF4P18085 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARF4P18085 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARF4P18085 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARF4P18085 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARF4P18085 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARF4P18085 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARF4P18085 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARF4P18085 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARF4P18085 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARF4P18085 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARF4P18085 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARF4P18085 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARF4P18085 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARF4P18085 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARF4P18085 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARF4P18085 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARF4P18085 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARF4P18085 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARF4P18085 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARF4P18085 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARF4P18085 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARF4P18085 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARF4P18085 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARF4P18085 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARF4P18085 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARF4P18085 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms