Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-EP13747 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-EP13747 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-EP13747 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-EP13747 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms