Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT10P13645 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT10P13645 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT10P13645 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT10P13645 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT10P13645 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT10P13645 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT10P13645 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT10P13645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT10P13645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT10P13645 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT10P13645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT10P13645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT10P13645 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT10P13645 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT10P13645 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT10P13645 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT10P13645 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT10P13645 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT10P13645 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT10P13645 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT10P13645 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT10P13645 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT10P13645 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT10P13645 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT10P13645 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT10P13645 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT10P13645 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT10P13645 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT10P13645 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT10P13645 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT10P13645 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT10P13645 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT10P13645 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT10P13645 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT10P13645 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT10P13645 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT10P13645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT10P13645 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT10P13645 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT10P13645 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT10P13645 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT10P13645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT10P13645 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT10P13645 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT10P13645 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT10P13645 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT10P13645 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT10P13645 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT10P13645 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT10P13645 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT10P13645 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT10P13645 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT10P13645 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms