Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VIL1P09327 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VIL1P09327 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VIL1P09327 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VIL1P09327 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VIL1P09327 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VIL1P09327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VIL1P09327 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VIL1P09327 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VIL1P09327 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VIL1P09327 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VIL1P09327 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
VIL1P09327 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VIL1P09327 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VIL1P09327 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
VIL1P09327 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VIL1P09327 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VIL1P09327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
VIL1P09327 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VIL1P09327 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VIL1P09327 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VIL1P09327 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VIL1P09327 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
VIL1P09327 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VIL1P09327 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VIL1P09327 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VIL1P09327 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VIL1P09327 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VIL1P09327 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VIL1P09327 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VIL1P09327 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
VIL1P09327 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VIL1P09327 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VIL1P09327 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VIL1P09327 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
VIL1P09327 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIL1P09327 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
VIL1P09327 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIL1P09327 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VIL1P09327 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
VIL1P09327 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIL1P09327 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIL1P09327 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIL1P09327 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VIL1P09327 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIL1P09327 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIL1P09327 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIL1P09327 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIL1P09327 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VIL1P09327 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VIL1P09327 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VIL1P09327 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIL1P09327 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIL1P09327 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VIL1P09327 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIL1P09327 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VIL1P09327 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
VIL1P09327 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIL1P09327 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VIL1P09327 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIL1P09327 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIL1P09327 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIL1P09327 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIL1P09327 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VIL1P09327 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VIL1P09327 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VIL1P09327 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VIL1P09327 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VIL1P09327 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VIL1P09327 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms