Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRAP08240 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRAP08240 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPRAP08240 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRAP08240 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms