Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB3P05106 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB3P05106 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB3P05106 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms