Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB6O95452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB6O95452 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB6O95452 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB6O95452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB6O95452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB6O95452 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB6O95452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB6O95452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB6O95452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB6O95452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB6O95452 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB6O95452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB6O95452 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB6O95452 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB6O95452 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB6O95452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB6O95452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB6O95452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB6O95452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB6O95452 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB6O95452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB6O95452 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB6O95452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB6O95452 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB6O95452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB6O95452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB6O95452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB6O95452 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB6O95452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB6O95452 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB6O95452 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB6O95452 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB6O95452 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB6O95452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB6O95452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB6O95452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB6O95452 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB6O95452 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB6O95452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB6O95452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB6O95452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB6O95452 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB6O95452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB6O95452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB6O95452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB6O95452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB6O95452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB6O95452 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB6O95452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB6O95452 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB6O95452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB6O95452 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms