Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP19O94966 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
USP19O94966 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP19O94966 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP19O94966 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP19O94966 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP19O94966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP19O94966 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP19O94966 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP19O94966 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP19O94966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP19O94966 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP19O94966 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP19O94966 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP19O94966 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP19O94966 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP19O94966 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP19O94966 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP19O94966 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP19O94966 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP19O94966 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP19O94966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP19O94966 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP19O94966 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP19O94966 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP19O94966 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP19O94966 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP19O94966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP19O94966 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
USP19O94966 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP19O94966 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP19O94966 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP19O94966 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP19O94966 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP19O94966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP19O94966 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP19O94966 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP19O94966 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP19O94966 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP19O94966 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP19O94966 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP19O94966 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP19O94966 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP19O94966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP19O94966 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP19O94966 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP19O94966 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP19O94966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP19O94966 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP19O94966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP19O94966 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP19O94966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP19O94966 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP19O94966 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33■■■□□ 2.87
USP19O94966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP19O94966 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP19O94966 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP19O94966 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP19O94966 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP19O94966 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP19O94966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP19O94966 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP19O94966 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP19O94966 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP19O94966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP19O94966 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP19O94966 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP19O94966 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
USP19O94966 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP19O94966 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP19O94966 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP19O94966 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
USP19O94966 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP19O94966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP19O94966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP19O94966 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP19O94966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP19O94966 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms