Protein–RNA interactions for Protein: O75610

LEFTY1, Left-right determination factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY1O75610 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LEFTY1O75610 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LEFTY1O75610 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LEFTY1O75610 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms