Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OPHN1O60890 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
OPHN1O60890 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPHN1O60890 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms