Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QRK9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
J3QRK9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRK9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRK9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRK9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
J3QRK9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QRK9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QRK9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRK9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRK9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRK9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRK9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QRK9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QRK9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRK9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRK9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRK9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRK9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QRK9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QRK9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRK9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QRK9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QRK9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
J3QRK9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
J3QRK9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QRK9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRK9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QRK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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