Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
H7C1W4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
H7C1W4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
H7C1W4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
H7C1W4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
H7C1W4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
H7C1W4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
H7C1W4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
H7C1W4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
H7C1W4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
H7C1W4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
H7C1W4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
H7C1W4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
H7C1W4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
H7C1W4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
H7C1W4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
H7C1W4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
H7C1W4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
H7C1W4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
H7C1W4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
H7C1W4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
H7C1W4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
H7C1W4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
H7C1W4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
H7C1W4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
H7C1W4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
H7C1W4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
H7C1W4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
H7C1W4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
H7C1W4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
H7C1W4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
H7C1W4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
H7C1W4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
H7C1W4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
H7C1W4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
H7C1W4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
H7C1W4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
H7C1W4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
H7C1W4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
H7C1W4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
H7C1W4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
H7C1W4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
H7C1W4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
H7C1W4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
H7C1W4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
H7C1W4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
H7C1W4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
H7C1W4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
H7C1W4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
H7C1W4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
H7C1W4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
H7C1W4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
H7C1W4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
H7C1W4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
H7C1W4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
H7C1W4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
H7C1W4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
H7C1W4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
H7C1W4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H7C1W4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H7C1W4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H7C1W4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H7C1W4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H7C1W4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
H7C1W4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
H7C1W4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
H7C1W4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
H7C1W4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms