Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H3BQV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H3BQV1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H3BQV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H3BQV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H3BQV1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BQV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H3BQV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H3BQV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H3BQV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
H3BQV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H3BQV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
H3BQV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQV1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H3BQV1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQV1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H3BQV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H3BQV1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H3BQV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H3BQV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H3BQV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BQV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BQV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BQV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H3BQV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BQV1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BQV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BQV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H3BQV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H3BQV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms