Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMG1C9JSJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHMG1C9JSJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms