Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM90A20PA6NIJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM90A20PA6NIJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM90A20PA6NIJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms