Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRR23AA6NEV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRR23AA6NEV1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRR23AA6NEV1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRR23AA6NEV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms