Protein–RNA interactions for Protein: A6NDX5

ZNF840P, Putative zinc finger protein 840, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF840PA6NDX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF840PA6NDX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF840PA6NDX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF840PA6NDX5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms