Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J2E0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2E0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2E0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms