Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y399

MRPS2, 28S ribosomal protein S2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS2Q9Y399 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPS2Q9Y399 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPS2Q9Y399 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPS2Q9Y399 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPS2Q9Y399 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms