Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX4Q9Y2E6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX4Q9Y2E6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms