Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4AQ9UMR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLEC4AQ9UMR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLEC4AQ9UMR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms