Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTNNA3Q9UI47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTNNA3Q9UI47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTNNA3Q9UI47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTNNA3Q9UI47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms