Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPARGC1AQ9UBK2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms