Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A6Q9P2U8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A6Q9P2U8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms