Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AIPL1Q9NZN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AIPL1Q9NZN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AIPL1Q9NZN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AIPL1Q9NZN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AIPL1Q9NZN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AIPL1Q9NZN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms