Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XAB2Q9HCS7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XAB2Q9HCS7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XAB2Q9HCS7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms