Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUDS3Q9H7L9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUDS3Q9H7L9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUDS3Q9H7L9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUDS3Q9H7L9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms