Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN4RQ9BZR6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4RQ9BZR6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN4RQ9BZR6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms