Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SYCP2Q9BX26 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SYCP2Q9BX26 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SYCP2Q9BX26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SYCP2Q9BX26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SYCP2Q9BX26 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms