Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC94Q9BW85 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC94Q9BW85 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC94Q9BW85 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms