Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MIPEPQ99797 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MIPEPQ99797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MIPEPQ99797 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms